Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbtb39Q6PDK0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbtb39Q6PDK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms