Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SvoplQ6PDF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SvoplQ6PDF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms