Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bhlhb9Q6PB60 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bhlhb9Q6PB60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms