Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Herc4Q6PAV2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc4Q6PAV2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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