Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rexo4Q6PAQ4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rexo4Q6PAQ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms