Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkab2Q6PAM0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkab2Q6PAM0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms