Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Lce3fQ6PAI4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms