Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc148Q6P5U8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms