Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam222bQ6P539 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms