Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HelbQ6NVF4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HelbQ6NVF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms