Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc66Q6NS45 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc66Q6NS45 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms