Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms