Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep78Q6IRU7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms