Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CltbQ6IRU5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CltbQ6IRU5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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