Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best3Q6H1V1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best3Q6H1V1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms