Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scaf8Q6DID3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf8Q6DID3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf8Q6DID3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms