Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11bQ6DFW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp11bQ6DFW5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms