Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Thsd7aQ69ZU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thsd7aQ69ZU6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thsd7aQ69ZU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms