Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sv2cQ69ZS6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms