Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzrn3Q69ZS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms