Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn2Q68FG2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms