Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab3ipQ68EF0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms