Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ino80dQ66JY2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ino80dQ66JY2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms