Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irf4Q64287 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms