Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccdc18Q640L5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc18Q640L5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc18Q640L5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
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