Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PatjQ63ZW7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PatjQ63ZW7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms