Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup62Q63850 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms