Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms