Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vat1Q62465 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms