Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20809Q62458 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20809Q62458 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20809Q62458 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20809Q62458 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20809Q62458 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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