Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Supt6hQ62383 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Supt6hQ62383 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Supt6hQ62383 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms