Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox19Q62249 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox19Q62249 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms