Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim27Q62158 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Trim27Q62158 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Trim27Q62158 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Trim27Q62158 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Trim27Q62158 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim27Q62158 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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