Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkd1Q62101 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms