Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtafrQ62035 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtafrQ62035 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms