Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrc1Q61830 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrc1Q61830 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms