Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrn1Q61809 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lrrn1Q61809 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms