Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga6Q61739 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itga6Q61739 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms