Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna15Q61718 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna15Q61718 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms