Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifi47Q61635 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ifi47Q61635 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ifi47Q61635 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifi47Q61635 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms