Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gli3Q61602 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gli3Q61602 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gli3Q61602 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms