Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd55bQ61476 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms