Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AcanQ61282 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AcanQ61282 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AcanQ61282 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AcanQ61282 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AcanQ61282 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AcanQ61282 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms