Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nell2Q61220 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Nell2Q61220 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nell2Q61220 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms