Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf9Q61179 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf9Q61179 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms