Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxf1Q61080 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxf1Q61080 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms