Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lama5Q61001 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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