Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxg1Q60987 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms