Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik1Q60934 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik1Q60934 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms