Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DbpQ60925 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DbpQ60925 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms